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Bernard R. Brooks

1962–2026 年に発表

133
論文数
39,027
被引用数
71
h 指数
115
i10 指数

被引用数

Bernard R. Brooks の年別被引用数1911 年: 被引用 1 件1962 年: 被引用 3 件1969 年: 被引用 1 件1970 年: 被引用 1 件1971 年: 被引用 1 件1972 年: 被引用 3 件1973 年: 被引用 2 件1974 年: 被引用 4 件1975 年: 被引用 1 件1976 年: 被引用 1 件1977 年: 被引用 2 件1978 年: 被引用 1 件1979 年: 被引用 3 件1980 年: 被引用 6 件1981 年: 被引用 4 件1982 年: 被引用 7 件1983 年: 被引用 6 件1984 年: 被引用 11 件1985 年: 被引用 22 件1986 年: 被引用 23 件1987 年: 被引用 32 件1988 年: 被引用 41 件1989 年: 被引用 39 件1990 年: 被引用 51 件1991 年: 被引用 84 件1992 年: 被引用 84 件1993 年: 被引用 94 件1994 年: 被引用 103 件1995 年: 被引用 127 件1996 年: 被引用 154 件1997 年: 被引用 200 件1998 年: 被引用 199 件1999 年: 被引用 184 件2000 年: 被引用 196 件2001 年: 被引用 192 件2002 年: 被引用 268 件2003 年: 被引用 236 件2004 年: 被引用 260 件2005 年: 被引用 338 件2006 年: 被引用 279 件2007 年: 被引用 344 件2008 年: 被引用 356 件2009 年: 被引用 469 件2010 年: 被引用 348 件2011 年: 被引用 360 件2012 年: 被引用 292 件2013 年: 被引用 291 件2014 年: 被引用 284 件2015 年: 被引用 297 件2016 年: 被引用 250 件2017 年: 被引用 209 件2018 年: 被引用 233 件2019 年: 被引用 607 件2020 年: 被引用 633 件2021 年: 被引用 648 件2022 年: 被引用 557 件2023 年: 被引用 398 件2024 年: 被引用 642 件2025 年: 被引用 321 件2026 年: 被引用 41 件1912〜1961 年は被引用が無いため表示していません1963〜1968 年は被引用が無いため表示していません

引用元

国・地域

この著者を引用した国・地域の世界地図アメリカ合衆国: 引用元論文 4,738 件、この内訳の 37.6%中国: 引用元論文 861 件、この内訳の 6.8%ドイツ: 引用元論文 769 件、この内訳の 6.1%イギリス: 引用元論文 681 件、この内訳の 5.4%フランス: 引用元論文 571 件、この内訳の 4.5%インド: 引用元論文 372 件、この内訳の 3%スイス: 引用元論文 363 件、この内訳の 2.9%イタリア: 引用元論文 341 件、この内訳の 2.7%日本: 引用元論文 319 件、この内訳の 2.5%カナダ: 引用元論文 268 件、この内訳の 2.1%スウェーデン: 引用元論文 240 件、この内訳の 1.9%スペイン: 引用元論文 236 件、この内訳の 1.9%
0%37.6%その他 22.6%

機関

分野

  • Biochemistry, Genetics and Molecular Biology52%
  • Computer Science10.2%
  • Medicine9.9%
  • Physics and Astronomy6.8%
  • Materials Science5.5%
  • Chemistry4.5%
  • その他11.1%

トピック

  • Protein Structure and Dynamics14.9%
  • Computational Drug Discovery Methods5.8%
  • Enzyme Structure and Function5.4%
  • Spectroscopy and Quantum Chemical Studies4.3%
  • Lipid Membrane Structure and Behavior3.1%
  • RNA and protein synthesis mechanisms3.1%
  • その他63.4%

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  1. Constant pressure molecular dynamics simulation: The Langevin piston method

    著者: Scott E. Feller, Yuhong Zhang, Richard W. Pastor, Bernard R. Brooks - The Journal of Chemical Physics 1995 被引用: 4,525

  2. CHARMM: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations

    著者: Bernard R. Brooks, Robert E. Bruccoleri, Barry D. Olafson, David J. States, S. Swaminathan, Martin Karplus - Journal of Computational Chemistry 1983 被引用: 14,945

  3. P SI4 1.4: Open-source software for high-throughput quantum chemistry

    著者: Daniel G. A. Smith, Lori A. Burns, Andrew C. Simmonett, Robert M. Parrish, Matthew Cole Schieber, Raimondas Galvelis, Peter Kraus, Holger Kruse, Roberto Di Remigio, Asem Alenaizan, Andrew M. James, Susi Lehtola, Jonathon P. Misiewicz, Maximilian Scheurer, Robert A. Shaw, Jeffrey B. Schriber, Yi Xie, Zachary L. Glick, Dominic A. Sirianni, Joseph O'Brien, Jonathan M. Waldrop, Ashutosh Kumar, Edward G. Hohenstein, Benjamin P. Pritchard, Bernard R. Brooks, Henry F. Schaefer, Alexander Yu. Sokolov, Konrad Patkowski, A. Eugene DePrince, Uğur Bozkaya, Rollin A. King, Francesco A. Evangelista, Justin M. Turney, T. Daniel Crawford, C. David Sherrill - The Journal of Chemical Physics 2020 被引用: 1,001

  4. Langevin dynamics of peptides: The frictional dependence of isomerization rates of N‐acetylalanyl‐N′‐methylamide

    著者: Richard J. Loncharich, Bernard R. Brooks, Richard W. Pastor - Biopolymers 1992 被引用: 1,199

  5. OpenMM 7: Rapid development of high performance algorithms for molecular dynamics

    著者: Peter K. Eastman, Jason M. Swails, John D. Chodera, Robert McGibbon, Yutong Zhao, Kyle Beauchamp, Lee-Ping Wang, Andrew C. Simmonett, Matthew P. Harrigan, Chaya D. Stern, Rafal P. Wiewiora, Bernard R. Brooks, Vijay S. Pande - PLoS Computational Biology, PLoS Comput. Biol. 2016 被引用: 2,763

  6. Albumin-chaperoned cyanine dye yields superbright NIR-II fluorophore with enhanced pharmacokinetics

    著者: Rui Tian, Qiao Zeng, Shoujun Zhu, Joseph Lau, Swati Chandra, Robert Ertsey, Kenneth S. Hettie, Nutte Teraphongphom, Zhubin Hu, Gang Niu, Dale O. Kiesewetter, Haitao Sun, Xiaodong Zhang, Alexander L. Antaris, Bernard R. Brooks, Xiaoyuan Chen - Science Advances 2019 被引用: 261

  7. An analysis of the accuracy of Langevin and molecular dynamics algorithms

    著者: Richard W. Pastor, Bernard R. Brooks, Attila Szabó - Molecular Physics 1988 被引用: 1,072

  8. New Spherical-Cutoff Methods for Long-Range Forces in Macromolecular Simulation

    著者: Peter J. Steinbach, Bernard R. Brooks - Journal of Computational Chemistry, J. Comput. Chem. 1994 被引用: 1,163

  9. Solvent-Induced Forces between Two Hydrophilic Groups

    著者: Stewart R. Durell, Bernard R. Brooks, Arieh Ben‐Naim - The Journal of Physical Chemistry 1994 被引用: 614

  10. A protocol for preparing explicitly solvated systems for stable molecular dynamics simulations

    著者: Daniel R. Roe, Bernard R. Brooks - The Journal of Chemical Physics 2020 被引用: 104

  11. CHARMM at 45: Enhancements in Accessibility, Functionality, and Speed

    著者: Wonmuk Hwang, Steven L. Austin, Arnaud Blondel, Eric D. Boittier, Stefan Boresch, Matthias Buck, Joshua Buckner, Amedeo Caflisch, Hao-Ting Chang, Xi Cheng, Yeol Kyo Choi, Jhih‐Wei Chu, Michael F. Crowley, Qiang Cui, A. Damjanović, Yuqing Deng, M. Devereux, Xinqiang Ding, Michael Feig, Jiali Gao, David R. Glowacki, James E. Gonzales, Mehdi Bagheri Hamaneh, Edward Harder, Ryan L. Hayes, Jing Huang, Yandong Huang, Phillip S. Hudson, Wonpil Im, Shahidul M. Islam, Wei Jiang, Michael R. Jones, Silvan Käser, Fiona L. Kearns, Nathan R. Kern, Jeffery B. Klauda, Themis Lazaridis, Jinhyuk Lee, Justin A. Lemkul, Xiaorong Liu, Yun Luo, Alexander D. MacKerell, Dan Thomas Major, Markus Meuwly, Kwangho Nam, Lennart Nilsson, Victor Ovchinnikov, Emanuele Paci, Soohyung Park, Richard W. Pastor, Amanda R. Pittman, Carol Beth Post, Samarjeet Prasad, Jingzhi Pu, Yifei Qi, Thenmalarchelvi Rathinavelan, Daniel R. Roe, Benoı̂t Roux, Christopher N. Rowley, Jana Shen, Andrew C. Simmonett, Alexander J. Sodt, Kai Töpfer, Meenu Upadhyay, Arjan van der Vaart, Luis Itza Vazquez-Salazar, Richard M. Venable, Luke Warrensford, H. Lee Woodcock, Yujin Wu, Charles L. Brooks, Bernard R. Brooks, Martin Karplus - The Journal of Physical Chemistry B 2024 被引用: 114

  12. GraphVAMPNet, using graph neural networks and variational approach to markov processes for dynamical modeling of biomolecules

    著者: Mahdi Ghorbani, Samarjeet Prasad, Jeffery B. Klauda, Bernard R. Brooks - The Journal of Chemical Physics 2022 被引用: 48

  13. CHARMM36 Lipid Force Field with Explicit Treatment of Long-Range Dispersion: Parametrization and Validation for Phosphatidylethanolamine, Phosphatidylglycerol, and Ether Lipids

    著者: Yalun Yu, Andreas Krämer, Richard M. Venable, Bernard R. Brooks, Jeffery B. Klauda, Richard W. Pastor - Journal of Chemical Theory and Computation 2021 被引用: 116

  14. A compression strategy for particle mesh Ewald theory

    著者: Andrew C. Simmonett, Bernard R. Brooks - The Journal of Chemical Physics 2021 被引用: 95

  15. Effects of pH on Proteins: Predictions for Ensemble and Single-Molecule Pulling Experiments

    著者: Edward P. O’Brien, Bernard R. Brooks, D. Thirumalai - Journal of the American Chemical Society 2011 被引用: 115

  16. Self-guided Langevin dynamics simulation method

    著者: Xiongwu Wu, Bernard R. Brooks - Chemical Physics Letters 2003 被引用: 465

  17. Semi-automated Optimization of the CHARMM36 Lipid Force Field to Include Explicit Treatment of Long-Range Dispersion

    著者: Yalun Yu, Andreas Krämer, Richard M. Venable, Andrew C. Simmonett, Alexander D. MacKerell, Jeffery B. Klauda, Richard W. Pastor, Bernard R. Brooks - Journal of Chemical Theory and Computation 2021 被引用: 78

  18. pH replica‐exchange method based on discrete protonation states

    著者: Satoru Itoh, A. Damjanović, Bernard R. Brooks - Proteins Structure Function and Bioinformatics 2011 被引用: 149

  19. Harmonic Analysis of Large Systems. I. Methodology

    著者: Bernard R. Brooks, Dusanka Janezic, Martin Karplus - Journal of Computational Chemistry, J. Comput. Chem. 1995 被引用: 497

  20. Optimization of quantum mechanical molecular mechanical partitioning schemes: Gaussian delocalization of molecular mechanical charges and the double link atom method

    著者: Debananda Das, Kirsten P. Eurenius, Eric M. Billings, Paul Sherwood, David C. Chatfield, Milan Hodošček, Bernard R. Brooks - The Journal of Chemical Physics 2002 被引用: 190

  21. Membrane permeability of small molecules from unbiased molecular dynamics simulations

    著者: Andreas Krämer, An Ghysels, Eric Wang, Richard M. Venable, Jeffery B. Klauda, Bernard R. Brooks, Richard W. Pastor - The Journal of Chemical Physics 2020 被引用: 70

  22. Computer simulation of liquid/liquid interfaces. I. Theory and application to octane/water

    著者: Yuhong Zhang, Scott E. Feller, Bernard R. Brooks, Richard W. Pastor - The Journal of Chemical Physics 1995 被引用: 375

  23. Simulations of Membranes and Other Interfacial Systems Using P21 and Pc Periodic Boundary Conditions

    著者: Elizabeth A. Dolan, Richard M. Venable, Richard W. Pastor, Bernard R. Brooks - Biophysical Journal 2002 被引用: 83

  24. Protein p K a Prediction by Tree-Based Machine Learning

    著者: Ada Y. Chen, Juyong Lee, Ana Damjanović, Bernard R. Brooks - Journal of Chemical Theory and Computation 2022 被引用: 36